Die Große Domorgel auf der Westempore wurde von Gottfried Silbermann 1711 – 14 errichtet. Ihre 44 Stimmen sind auf drei Klaviaturen und das Pedal verteilt. Ihr Originalzustand mit der alten Stimmtonhöhe (ein Dreiviertelton höher als heute üblich) und die Charakteristik der ursprünglich mitteltönigen Temperatur sind weitgehend erhalten.
Die Kleine Silbermannorgel, für die Freiberger Hospital- oder St. Johanniskirche 1718/19 erbaut, befindet sich seit siebzig Jahren auf der nördlichen Seite des Lettners im Dom und besitzt 14 Stimmen.